FIDO Alliance introdujo adiciones a las especificaciones FIDO 1.0 con nuevos protocolos de transporte para FIDO U2F añadiendo Bluetooth de bajo consumo y comunicación de campo cercano. Con estas nuevas especificaciones de transporte, FIDO U2F es apropiada para las aplicaciones móviles e inalámbricas, y los dispositivos que no tienen un puerto USB. La especificación U2F de transporte Bluetooth permite la creación de dispositivos Bluetooth Smart U2F de fines especiales, en que solo se requiere pulsar un botón para autenticar en un servicio en línea.

Además, los teléfonos y periféricos que consumen más energía pueden programarse para que actúen como dispositivos U2F utilizando Bluetooth. La especificación de transporte U2F NFC permite la creación de dispositivos portátiles, tales como tarjetas de crédito y transmisores keyfob, con los que simplemente se da un toque contra el dispositivo para autenticar un servicio en línea. Opcionalmente puede programarse un teléfono móvil con capacidad NFC para que actúe como un dispositivo NFC U2F. Para autenticar, el usuario da un toque con el teléfono sobre el dispositivo de destino.